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Descrizione dell'insegnamento |
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Negli ultimi anni si è assistito ad un rapido sviluppo delle tecnologie biomediche, ma ancor di più dei dati che queste ultime riescono a produrre. Soprattutto grazie all’introduzione dei sequenziatori di nuova generazione l'ammontare dei dati prodotti è cresciuto notevolmente. Per tali motivi, l'informatica è diventata l'elemento chiave per analizzarli. Si sono per questo sviluppati algoritmi e risorse computazionali di supporto alla raccolta, alla memorizzazione e all’analisi di dati biologici. |
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Prerequisiti |
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Il corso di Introduzione ai Big Data. |
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Scopi |
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L'obiettivo del corso è fornire una conoscenza più approfondita delle tecniche di gestione ed analisi di grandi moli di dati biomedici. |
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Contenuti |
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Il corso analizzerà i vari aspetti della bioinformatica e dei big data, con particolare attenzione alle seguenti aree d’interesse: Introduzione alla biologia molecolare (la genomica, il DNA, l’RNA il codice genetico) La bioinformatica Il sequenziamento del DNA di nuova generazione (NGS) La crescita dei dati biologici e biomedici L’informatica biomedica Le cartelle cliniche elettroniche La raccolta dei dati biomedici e i database biomedici La gestione dei dati biomedici – Piattaforme distribuite ed infrastrutture per il NGS L’analisi dei dati biomedici La visualizzazione dei dati biomedici – Il genome browser Applicazioni: La classificazione, l’identificazione di virus e batteri, la diagnosi precoce La bioinformatica e la medicina personalizzata |
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Testi |
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M.Helmer Citterich - F.Ferrè - G.Pavesi - C.Romualdi - G.Pesole: FONDAMENTI DI BIOINFORMATICA. Zanichelli 2018 (ISBN 978-88-08-62112-2)
Altri testi consigliati:
Dan E. Krane, Michael L. Raymer. Fondamenti di bioinformatica. Pearson Education Italia. |
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Esercitazioni |
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Le esercitazioni presentate durante il corso coprono l'intero programma. |
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Docente |
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Emanuel Weitschek
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